डिस्क में अनुसंधान
विशिष्ट अनुसंधान के क्षेत्र
यह केंद्र पादप अनुसंधान के अग्रणी क्षेत्रों जैसे जीनोम माइनिंग, आणविक मानचित्रण, तनाव जीवविज्ञान और फसल सुधार के लिए पोषण जीनोमिक्स में मजबूत और निरंतर कार्यक्रम चला रहा है, जो उच्च उपज के लिए उन्नत किस्मों के विकास में योगदान दे रहे हैं। नेक्स्ट जेनरेशन सीक्वेंसिंग (एनजीएस) और हाई थ्रूपुट (एचटीपी) प्रोटिओमिक प्रयोगों से प्राप्त जैवआणविक डेटा (जीनोम, ट्रांसक्रिप्टोम, एपिजीनोम, प्रोटिओम और अन्य – विभिन्न कोशिकाओं, ऊतकों और जीवों से प्राप्त ओमिक्स डेटा) में हाल ही में हुई भारी वृद्धि के साथ, बड़े डेटासेट का निर्माण और विश्लेषण अब एनआईपीजीआर में अनुसंधान का एक नियमित और महत्वपूर्ण हिस्सा बन गया है।
BTISNET समन्वयक का समूह जीन अभिव्यक्ति के प्रतिलेखन विनियमन के क्षेत्र में कार्य करता है, जिसका मुख्य केंद्र मध्यस्थ परिसर है। समूह ने परिसर में उप-इकाइयों के संगठन और परिसर की लचीलता को समझने में महत्वपूर्ण प्रगति की है। समन्वयक के समूह की रुचि चावल और अरेबिडोप्सिस के जीनोमिक्स में भी है। सह-समन्वयक का समूह पादप जीनोम अनुसंधान के कई नए क्षेत्रों का अन्वेषण कर रहा है, जिसमें उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण डेटासेट का विश्लेषण करके नए अणुओं की पहचान, लक्षण वर्णन और सत्यापन शामिल है। उनके द्वारा चुने गए अणुओं में स्थानांतरण आरएनए-व्युत्पन्न खंड (जैसे tRFs), संलयन प्रतिलेख, वृत्ताकार आरएनए और राइबोसोमल आरएनए-व्युत्पन्न खंड (जैसे rRFs) शामिल हैं। इसके अतिरिक्त, वे जैविक अनुसंधान समुदाय के लिए इन सिलिको उपकरण, पाइपलाइन, वेब सर्वर और डेटाबेस भी विकसित कर रहे हैं।
वर्तमान शोध की मुख्य बाते
- हमने मध्यस्थ परिसर की अव्यवस्था का विश्लेषण किया और परिसर की समग्र संरचना की लचीलता को स्पष्ट किया। मध्यस्थ परिसर के क्षेत्र में यह एक महत्वपूर्ण योगदान है।
- हमने अरेबिडोप्सिस के मीडिएटर कॉम्प्लेक्स में उप-इकाइयों की व्यवस्था का अध्ययन किया। चूंकि पादप मीडिएटर कॉम्प्लेक्स की संरचना अभी तक स्पष्ट नहीं है, इसलिए यह शोधपत्र पादप मीडिएटर की संरचना और कार्यप्रणाली को समझने में महत्वपूर्ण योगदान देता है।
- चावल की चार किस्मों के संपूर्ण जीनोम अनुक्रमों का विश्लेषण किया गया। इससे अनाज के आकार/वजन से संबंधित तीन नए क्यूटीएल की पहचान करने में मदद मिली।
- हमने चावल के गुणसूत्र 5 के सेंट्रोमेरिक क्षेत्र के आसपास के कम विविधता वाले क्षेत्र का अध्ययन किया है। चावल के पालतूकरण को समझने में यह एक महत्वपूर्ण अध्ययन है।
- हम पौधों में दो नए अणुओं का अध्ययन कर रहे हैं, जैसे कि ट्रांसफर आरएनए-व्युत्पन्न खंड (टीआरएफ) और संलयन प्रतिलेख।
- हमने व्यापक डेटा संकलन किया और 10 विभिन्न पौधों की प्रजातियों के लिए तीनों प्रकार के tRF (जैसे tRF-5, tRF-3 और tRF-1) की पहचान की (अध्ययन प्रकाशित)। हमने tRF की पहचान के लिए एक सॉफ्टवेयर पैकेज भी विकसित किया है। हमने चावल, टमाटर और चना में विभिन्न तनाव स्थितियों में tRF की पहचान और विश्लेषण भी किया है।
- फ्यूजन ट्रांसक्रिप्ट्स, डीएनए या आरएनए स्तर पर संलयन के परिणामस्वरूप उत्पन्न होने वाले काइमेरिक आरएनए होते हैं। ये ट्रांसक्रिप्ट्स या तो लंबे नॉन-कोडिंग आरएनए के रूप में कार्य कर सकते हैं या नए काइमेरिक प्रोटीन को एनकोड कर सकते हैं। हमने अरेबिडोप्सिस थैलिआना के पेयर्ड-एंड आरएनए-सीक्वेंसिंग डेटासेट में फ्यूजन ट्रांसक्रिप्ट्स की पहचान करके इस कार्य की शुरुआत की।
- पौधों के टीआरआरएफ, टीआरएनए और संलयन प्रतिलेखों के पहले डेटाबेस हमारे समूह द्वारा विकसित किए गए थे।
- छोटे आरएनए अनुक्रमण डेटासेट में टीआरआरएफ की पहचान के लिए कार्यप्रणाली विकसित की, उदाहरण के लिए tRF-PRED: टीआरआरएफ की भविष्यवाणी के लिए सॉफ्टवेयर पैकेज।