मेटाबोलॉमिक्स सुविधा
मेटाबोलॉमिक्स सुविधा, एनआईपीजीआर
मास स्पेक्ट्रोमेट्री एक शक्तिशाली विश्लेषणात्मक तकनीक है जिसका उपयोग अज्ञात यौगिकों की पहचान करने और ज्ञात मेटाबोलाइट्स की मात्रा निर्धारित करने के लिए किया जाता है। भारत सरकार के जैव प्रौद्योगिकी विभाग (डीबीटी) द्वारा वित्त पोषित राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (एनआईपीजीआर) में मेटाबोलॉमिक्स सुविधा दिसंबर 2019 में पादप मेटाबोलॉमिक्स के लिए अत्याधुनिक विश्लेषणात्मक उपकरण मंच के रूप में कार्य करने के लिए शुरू की गई थी। यह भारत में अपनी तरह की एकमात्र सुविधा है जिसे पादप फाइटोहोर्मोन और कम मात्रा में पाए जाने वाले मेटाबोलाइट्स की मात्रा निर्धारण और प्रोफाइलिंग के लिए डिज़ाइन किया गया है। हम विभिन्न जैविक अध्ययनों के लिए विभिन्न प्रकार के मेटाबोलाइट्स के मास स्पेक्ट्रोमेट्री-आधारित विश्लेषण और पूर्ण मात्रा निर्धारण के लिए सेवाएं प्रदान करते हैं। यह सुविधा आंतरिक और बाहरी दोनों उपयोगकर्ताओं के लिए उपलब्ध है। इस सुविधा में जिन पादप मेटाबोलाइट्स का पता लगाया जा सकता है और उनकी मात्रा निर्धारित की जा सकती है, उनमें शामिल हैं:
- पादप पादप हार्मोन (रक्षा और वृद्धि हार्मोन)
- अमीनो अम्ल
- flavonoids
- प्राथमिक मेटाबोलाइट्स
- खनिज अनुमान
- अन्य कम मात्रा में पाए जाने वाले द्वितीयक मेटाबोलाइट्स
उपकरण
मेटाबोलॉमिक्स सुविधा में निम्नलिखित उपकरण उपलब्ध हैं:
- एलसी-एमएस/एमएस (ट्रिपल क्वाड्रुपोल)
- जीसी-एमएस/एमएस (ट्रिपल क्वाड्रुपोल)
- आईसीपी-एमएस
- एचपीटीएलसी
- यू-एचपीएलसी
- माइक्रोवेव पाचन प्रणाली
- जीनो ग्राइंडर
- घूर्णी निर्वात वाष्पीकरण यंत्र
- अल्ट्रा-टुरैक्स डिजिटल होमोजेनाइज़र
- अल्ट्रासोनिकेटर
- फ्रीजर
- एक प्रकार के बरतन
- स्पीड वैक
- पंपों के साथ वैक्यूम मैनिफोल्ड
- सटीक तराजू
पादप चयापचयों के अत्याधुनिक मात्रा निर्धारण के लिए मास स्पेक्ट्रोमेट्री
1) गैस क्रोमेटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री - GC-MS/MS (TQ8050 NX)
गैस क्रोमेटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री (GC-MS) एक विश्लेषणात्मक विधि है जो गैस क्रोमेटोग्राफी और मास स्पेक्ट्रोमेट्री की विशेषताओं को जोड़ती है , और उच्च हस्तक्षेप वाले मैट्रिक्स में अति सूक्ष्म मात्राओं का अभूतपूर्व मात्रात्मक विश्लेषण करने में सक्षम है। हमारे उपकरण के साथ थर्मल डिसॉर्प्शन सिस्टम भी उपलब्ध है।
जिन चीजों का मात्रात्मक विश्लेषण किया जा सकता है: अधिकांश प्राथमिक मेटाबोलाइट्स (जैसे शर्करा, शर्करा अल्कोहल, कार्बनिक अम्ल, कार्बनिक अम्ल एस्टर, अमीनो अम्ल), बेंजेनॉइड और टेरपेनॉइड वाष्पशील कार्बनिक यौगिक। स्कैन मोड पर लक्षित मेटाबोलाइट प्रोफाइलिंग नहीं की जा सकती।
2) लिक्विड क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री- एलसी-एमएस/एमएस (क्यूट्रैप 6500+)
QTRAP-LC-MS/MS प्रणाली एक हाइब्रिड ट्रिपल क्वाड्रपोल लीनियर आयन ट्रैप मास स्पेक्ट्रोमीटर है। इसका उपयोग लक्षित मेटाबोलॉमिक्स अनुप्रयोगों के लिए किया जाता है।
जिन चीजों का मात्रात्मक मापन किया जा सकता है: अमीनो एसिड, रक्षा फाइटोहोर्मोन (जैसे जैस्मोनिक एसिड, एब्सिसिक एसिड और सैलिसिलिक एसिड), वृद्धि फाइटोहोर्मोन (जैसे साइटोकिनिन, ऑक्सिन), द्वितीयक मेटाबोलाइट्स (जैसे फेनोलिक एसिड, एंथोसायनिन, फ्लेवोनोइड्स, संयुग्मित फेनोलिक यौगिक, एल्कलॉइड) को इस सुविधा में मापा जा सकता है।
3) उच्च प्रदर्शन पतली परत क्रोमैटोग्राफी (एचपीटीएलसी-सीएएमएजी)
एचपीटीएलसी स्वचालित उपकरणों के साथ टीएलसी का एक उन्नत रूप है और इसका उपयोग द्वितीयक मेटाबोलाइट्स की पहचान के लिए किया जाता है। पौधों से प्राप्त अधिकांश एंथोसायनिन और फ्लेवोनोइड्स को एचपीटीएलसी के माध्यम से उच्च रिज़ॉल्यूशन में अलग किया जा सकता है।
4) इंडक्टिवली कपल्ड प्लाज्मा मास स्पेक्ट्रोमेट्री - आईसीपी-एमएस (एजिलेंट 7800)
इंडक्टिवली कपल्ड प्लाज्मा मास स्पेक्ट्रोमेट्री (आईसीपी-एमएस) एक प्रकार की मास स्पेक्ट्रोमेट्री है जिसका उपयोग किसी नमूने में मौलिक विश्लेषण और सूक्ष्म धातुओं और अधात्विक आयनों का पता लगाने के लिए किया जाता है।
किन चीजों का मात्रात्मक विश्लेषण किया जा सकता है: धातु और अधात्विक तत्वीय आयन, आयनोम प्रोफाइलिंग
संपर्क
प्रभारी वैज्ञानिक:
डॉ. ज्योतिलक्ष्मी वडासेरी (पीआई)
डॉ. सेंथिल कुमार मुथप्पा (सह-पीआई)
डॉ. आशुतोष पांडे (सह-पीआई)
metabolome@nipgr.ac.in
बाहरी उपयोगकर्ताओं से अनुरोध है कि वे सुविधा केंद्र से संपर्क करें।
नमूना तैयार करने के प्रोटोकॉल और प्रशिक्षण सुविधा द्वारा प्रदान किए जाएंगे।
1) अनुभाग : लिंक
2) अनुभाग: कर्मचारी
जगदीप सिंह (एसटीओ)
अचल प्रसाद (टीओ)
दिव्या गोयल (टीओ)
खुशबू शर्मा (एसपीए)