एनआईपीजीआर में स्वचालित डीएनए अनुक्रमण सुविधा एबीआई3730एक्सएल डीएनए विश्लेषक से सुसज्जित है, जो दो घंटे में छियानवे नमूनों का विश्लेषण करने में सक्षम है। एबीआई9700 पीसीआर साइक्लर की सहायता से चक्र अनुक्रमण के लिए बिग डाई टर्मिनेटर केमिस्ट्री संस्करण 3.1 का उपयोग किया जा रहा है। एक वरिष्ठ तकनीकी अधिकारी इस सुविधा का प्रबंधन करते हैं। क्लोन किए गए डीएनए, पीसीआर उत्पाद और बीएसी एंड्स का विश्लेषण पीओपी7 पॉलीमर और 50 सेमी ऐरे का उपयोग करके किया जाता है, जो 900 बेस रीड उत्पन्न करने में सक्षम है। एएफएलपी प्रतिक्रिया उत्पादों का भी विश्लेषण किया जाता है।