डाटाबेस और उपकरण


NIPGR द्वारा विकसित ऑनलाइन उपकरण और संसाधन
सं. डेटाबेस नाम विवरण PMID ग्रुप लीडर
47. SCIPDb प्लांट डेटाबेस में तनाव संयोजन और उनकी परस्पर क्रिया 37824297 डॉ. सेंथिल-कुमार मुथप्पा
46. PFusionDB प्लांट फ्यूजन डेटाबेस -- डॉ. शैलेश कुमार
45. smAMPsTK पौधों की प्रजातियों के smORFome एन्कोडिंग AMPs को उजागर करने के लिए एक टूलकिट -- डॉ. शैलेश कुमार
44. rsRNAfinder राइबोसोमल आरएनए-व्युत्पन्न छोटे आरएनए (आरएसआरएनए) की पहचान और एनोटेट करने के लिए एक उपकरण -- डॉ. शैलेश कुमार
43. कॉटन नॉन-कोडिंग आरएनए एटलस कॉटन नॉन-कोडिंग आरएनए (एनसीआरएनए) जीन और परिपक्व एनसीआरएनए एनोटेशन, अभिव्यक्ति स्तर, अनुक्रम और कपास ऊतकों, सेल प्रकारों, विकासात्मक और तनाव स्थितियों में आरएनए प्रसंस्करण जानकारी के सभी प्रमुख वर्गों पर आज तक की व्यापक अभिव्यक्ति और प्रसंस्करण जानकारी को सूचीबद्ध करता है। डेटाबेस की सामग्री एनोटेशन डेटा को क्यूरेशन, एनोटेशन और आरएनए/छोटे आरएनए अनुक्रम के कम्प्यूटेशनल विश्लेषण के साथ एकीकृत करने से प्राप्त होती है। -- डॉ. शैलेश कुमार
42. PTPAMP पौधे से प्राप्त रोगाणुरोधी पेप्टाइड्स के लिए पूर्वानुमान उपकरण -- डॉ. शैलेश कुमार
41. PtncRNAdb PtncRNAdb एक डेटाबेस है जिसे विशेष रूप से पौधों के लिए विकसित किया गया है, जिसमें छह विविध पौधों की प्रजातियों से छोटे आरएनए अनुक्रमण डेटा का विश्लेषण किया गया है -- डॉ. शैलेश कुमार
40. tncRNA उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण डेटा से tRNA-व्युत्पन्न छोटे ncRNAs (tncRNAs) की पहचान के लिए एक पाइपलाइन 34630945 डॉ. शैलेश कुमार
39. AlnC एंजियोस्पर्म में लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (lncRNAs) का एक व्यापक डेटाबेस 33852582 डॉ. शैलेश कुमार
38. MedProDB मध्यस्थ प्रोटीन डेटाबेस 34527190 डॉ. शैलेश कुमार
37. RiceSzWtBase चावल बहुरूपता का एक डेटाबेस -- डॉ. जितेन्द्र के ठाकुर
36. PtRNAdb tRNA जीन की जानकारी युक्त डेटाबेस. -- डॉ. शैलेश कुमार
35. PlantPepDB विभिन्न कार्यों और चिकित्सीय गतिविधियों वाले पादप पेप्टाइड्स का डेटाबेस। 32042035 डॉ. शैलेश कुमार
34. AtFusionDB अरबीडोप्सिस थालियाना में फ्यूजन ट्रांसक्रिप्ट का एक डेटाबेस। 30624648 डॉ. शैलेश कुमार
33. PVsiRNAdb प्लांट वायरस siRNA डेटाबेस. 30307523 डॉ. शैलेश कुमार
32. चना जीनोम विश्लेषण परियोजना (CGAP) [उन्नत ड्राफ्ट जीनोम (CGAP-3)] चना जीनोम विश्लेषण परियोजना वेब पोर्टल जिसमें NIPGR में अनुक्रमित चना जीनोम की संपूर्ण जीनोम असेंबली और एनोटेशन की जानकारी है। -- डॉ. देबाशीष चट्टोपाध्याय
31. PtRFdb प्लांट ट्रांसफर आरएनए-व्युत्पन्न टुकड़ों के लिए एक डेटाबेस। 29939244 डॉ.शैलेश कुमार
30. KIXBASE KIXBASE में KIX अनुक्रमों का सबसे बड़ा ऑनलाइन संग्रह शामिल है, जो अनुक्रम और संरचना दोनों के स्तर पर आकलन करने में सक्षम बनाता है, PSIPRED और MUSTER को आगे की व्याख्या और गुणवत्ता मूल्यांकन के लिए बैकएंड पर शामिल किया गया है। 29097748 डॉ. गीतांजलि यादव,

डॉ. जितेन्द्र के ठाकुर
29. CicerTransDB CicerTransDB एक खाद्य फली, छोले में ट्रांसक्रिप्शन कारकों (TFs) की एक केंद्रीकृत कथित रूप से पूर्ण सूची प्रदान करता है। यह छोले (सिसर एरीटिनम एल.) एनोटेशन v 1.0 पर आधारित है। डेटाबेस जीनोम-वाइड डोमेन अध्ययन और TF परिवारों के मैनुअल वर्गीकरण का परिणाम है। 27472917 डॉ. निरंजन चक्रवर्ती
28. CMsDB-चना चना माइक्रोसेटेलाइट डेटाबेस 26347762 डॉ. मुकेश जैन
27. जंगली चना जीनोम विश्लेषण परियोजना (WCGAP) जंगली चना जीनोम विश्लेषण परियोजना (WCGAP) के लिए वेब-पोर्टल। यह पोर्टल NIPGR में अनुक्रमित जंगली प्रकार के चने के जीनोम की संपूर्ण जीनोम असेंबली और एनोटेशन से संबंधित जानकारी प्रदान करता है। 27567261 डॉ. देबाशीष चट्टोपाध्याय
26. चने पर अगली पीढ़ी का चैलेंज प्रोग्राम जीनोमिक्स (NGCPCG) चने पर अगली पीढ़ी का चैलेंज प्रोग्राम जीनोमिक्स (NGCPCG) के लिए वेब-पोर्टल --  
25. CTDB कार्यात्मक और अनुप्रयुक्त जीनोमिक्स के लिए एक एकीकृत चना ट्रांसक्रिप्टोम डेटाबेस। 26322998 डॉ. मुकेश जैन
24. FmTEMDb फॉक्सटेल मिलेट ट्रांसपोज़ेबल एलिमेंट-आधारित मार्कर डेटाबेस संबंधित मार्कर जानकारी के साथ पूर्ण TE डेटा का भंडार है। 25428892 डॉ. मनोज प्रसाद
23. FmTFDb बाजरा में कार्यात्मक जीनोमिक्स को तेज करने के लिए फॉक्सटेल बाजरा प्रतिलेखन कारक डेटाबेस 25005261 डॉ. मनोज प्रसाद
22. FmMiRNADb वैश्विक वैज्ञानिक समुदाय को उत्पन्न miRNA मार्कर जानकारी प्रदान करने वाला डेटाबेस जिसमें miRNA जानकारी जैसे कि उनके गुणसूत्र स्थान, लंबाई, MFE, AMFE, प्री-miRNA और परिपक्व miRNA के अनुक्रम, द्वितीयक संरचना और लक्ष्य जीन जानकारी तक पहुँच शामिल है। -- डॉ. मनोज प्रसाद
21. EssOilDB प्लांट किंगडम में टेरपीन संरचना और परिवर्तनशीलता को दर्शाने वाले आवश्यक तेलों का डेटाबेस 25534749 डॉ. गीतांजलि यादव
20. TGRD बुनियादी और अनुप्रयुक्त अनुसंधान के लिए उपयोगी टमाटर जीनोमिक जानकारी का एक एकीकृत भंडार। 24466070 डॉ. देबासिस चट्टोपाध्याय
19. RiceSRTFDB चावल प्रतिलेखन कारकों का एक डेटाबेस जिसमें व्यापक अभिव्यक्ति, सीआईएस-नियामक तत्व और जीन फ़ंक्शन विश्लेषण को सुविधाजनक बनाने के लिए उत्परिवर्ती जानकारी शामिल है 23660286 डॉ. मुकेश जैन
18. FmMDb बाजरा और बायोएनर्जी घास शोध के लिए फॉक्सटेल बाजरा मार्करों का एक बहुमुखी डेटाबेस। 23951158 डॉ. मनोज प्रसाद
17. टेरजाइम प्लांट टेरपेनोम की पहचान और विश्लेषण के लिए एक उपकरण। 29339971 डॉ. गीतांजलि यादव
16. VIGS टूल फसल पौधों में कई अजैविक-तनाव-प्रतिक्रियाशील जीनों की कार्यात्मक प्रासंगिकता को उजागर करने के लिए एक बहुमुखी उपकरण। 25071806 डॉ. मुथप्पा सेंथिल-कुमार
15. NGS QC टूलकिट अगली पीढ़ी के अनुक्रमण डेटा के गुणवत्ता नियंत्रण के लिए एक टूलकिट। 22312429 डॉ. मुकेश जैन
14. MaCgene ब्राउज़र मैपिंग और क्लस्टरिंग जीन के लिए ब्राउज़र -- डॉ. गीतांजलि यादव
13. चना ब्राउज़र चना के लिए एक जीनोम ब्राउज़र -- प्रो. अखिलेश के. त्यागी
12. NEXCADE जटिल नेटवर्क के लिए गड़बड़ी विश्लेषण 22870252 डॉ. गीतांजलि यादव
11. PlecDom प्लांट लेक्टिन डोमेन की पहचान और विश्लेषण के लिए एक प्रोग्राम। 19474338 डॉ. गीतांजलि यादव
10. चना जीनोमिक वेब संसाधन (CGWR) फलीदार फसलों के तुलनात्मक अन्वेषण के लिए देसी प्रकार के सिसर एरियेटिनम परमाणु जीनोम का विज़ुअलाइज़ेशन और विश्लेषण। 25518738 डॉ. गीतांजलि यादव
8. RiceSRTFDB चावल प्रतिलेखन कारकों का एक डेटाबेस जिसमें जीन फ़ंक्शन विश्लेषण को सुविधाजनक बनाने के लिए व्यापक अभिव्यक्ति, सिस-नियामक तत्व और उत्परिवर्ती जानकारी शामिल है। 23660286 डॉ. मुकेश जैन
7. PlantRGS पौधों में मात्रात्मक जीन अभिव्यक्ति अध्ययन के लिए सबसे उपयुक्त उम्मीदवार संदर्भ जीन की पहचान के लिए एक वेब सर्वर 21987088 डॉ. मुकेश जैन
6. चावल एसएनपी डिस्कवरी अजैविक तनावों के प्रति विपरीत प्रतिक्रिया के साथ चावल अभिगमों के बीच एसएनपी डेटा -- डॉ. मुकेश जैन
5. कैथरैन्थस ट्रांसक्रिप्टोम ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रम, कार्यात्मक एनोटेशन, जीन अभिव्यक्ति और माइक्रोसैटेलाइट डेटा -- डॉ. मुकेश जैन
4. पोर्टेरेसिया ट्रांसक्रिप्टोम ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रम और कार्यात्मक एनोटेशन डेटा -- डॉ. मुकेश जैन
3. इंटरैक्टिव जीनोम मैप्स फॉर प्लांट्स (IGMAP) इंटरैक्टिव जीनोम मैप्स फॉर प्लांट्स (IGMAP) जीन या जीन परिवारों के जीनोम वाइड मैप्स को देखने और उनका आकलन करने के लिए एक मंच है। 25623471 डॉ. गीतांजलि यादव
2. ORF पूर्वानुमान कार्यक्रम यह कार्यक्रम स्वचालित कम्प्यूटेशनल विश्लेषण को सक्षम बनाता है, जिससे जीवाणु जैवसंश्लेषण जीन क्लस्टर में ORFs के सही क्रम का पूर्वानुमान लगाया जा सकता है। -- डॉ. गीतांजलि यादव
1. RManager यह प्रोग्राम अनिवार्य रूप से किसी संगठन के भीतर उपलब्ध संदर्भ लेखों का डेटाबेस है, जो सभी एक ही सर्वर में रखे गए हैं, जिससे डिस्क स्पेस का बेहतर उपयोग संभव होता है और लैब के भीतर उपयोगकर्ताओं को एक दूसरे के साथ साहित्य डेटा साझा करने और फ़ाइलों को एक निर्दिष्ट क्षेत्र में सुविधाजनक रूप से अपलोड और संग्रहीत करने की अनुमति मिलती है। -- डॉ. गीतांजलि यादव