डेटाबेस और टूल्स


एनआईपीजीआर में विकसित ऑनलाइन डेटाबेस

चना जीनोमिक वेब संसाधन (CGWR):
डॉ. गीतांजलि यादव
'चना जीनोमिक वेब संसाधन' चना जीनोम से संबंधित डेटा को समझने का तरीका प्रदान करता है। इसका 'ब्राउज़र' अनुभाग चने के पूरे जीनोम को संबंधित विशेषताओं के साथ संक्षिप्त ग्राफ़िकल तरीके से प्रदर्शित करता है।
URL: http://www.nipgr.res.in/CGWR/


पौधों के लिए इंटरैक्टिव जीनोम मानचित्र (आईजीएमएपी)
डॉ. गीतांजलि यादव
इंटरैक्टिव जीनोम मैप्स फॉर प्लांट्स (आईजीएमएपी) जीन या जीन परिवारों के जीनोम वाइड मैप्स को देखने और उनका आकलन करने का एक प्लेटफॉर्म है। वर्तमान में आईजीएमएपी का उपयोग 19 प्लांट जीनोम पर लगभग 615394 जीन और 422969 कार्यों का मानचित्र बनाने के लिए किया जा सकता है। इस प्लेटफॉर्म का उपयोग प्रीकंप्यूटेड जीनोमिक स्नैपशॉट के रूप में जीन या जीन परिवारों के जीनोम वाइड मैप्स को सीधे ब्राउज़ करने के लिए किया जा सकता है।
यूआरएल: http://nipgr.res.in/igmap.html


NEXCADE
डॉ. गीतांजलि यादव
नेक्सकेड जटिल प्रणालियों का विश्लेषण करने के लिए एक स्वचालित और इंटरैक्टिव प्रोग्राम है जिसे नेटवर्क द्वारा अवधारणाबद्ध किया जा सकता है, और इंटरैक्शन के इंटरकनेक्टेड मैट्रिसेस के रूप में दर्शाया जा सकता है। विश्लेषणात्मक ढांचा नेटवर्क पर विभिन्न प्रकार की गड़बड़ी को प्रेरित करने के लिए एक ग्राफ सैद्धांतिक दृष्टिकोण को नियोजित करता है जैसे विलुप्त होने कास्केड सिमुलेशन, गड़बड़ी के एक फ़ंक्शन के रूप में नेटवर्क की टोपोलॉजी और कनेक्टिविटी में परिवर्तन पर ध्यान केंद्रित करता है। गड़बड़ी को उपयोगकर्ता-परिभाषित तरीके से प्रेरित किया जाता है, जिसके बाद परिणामी उप-नेटवर्क का विश्लेषण किया जाता है।
URL: http://nipgr.res.in/nexcade.html


ऑनलाइन इंटरनेट सहायता:
डॉ. गीतांजलि यादव
इस ऑनलाइन पोर्टल का उद्देश्य संस्थान में सभी आईटी से संबंधित मुद्दों के लिए एक सहायक संरचना के रूप में कार्य करना है, इसके अलावा यह संस्थान में विभिन्न प्रयोगशालाओं में सभी उपयोगकर्ताओं, शोधकर्ताओं को कम्प्यूटेशनल सुविधाएं, लीज्ड लाइन का प्रबंधन और निरंतर नेटवर्क और इंटरनेट से संबंधित सहायता प्रदान करता है।
यूआरएल: http://www.nipgr.res.in/helpdesk.html


ओआरएफ भविष्यवाणी कार्यक्रम:
डॉ. गीतांजलि यादव
यह प्रोग्राम स्वचालित कम्प्यूटेशनल विश्लेषण को सक्षम बनाता है, जिससे बैक्टीरियल बायोसिंथेटिक जीन क्लस्टर में ORFs के सही क्रम की भविष्यवाणी की जा सकती है। इस प्रोग्राम का उपयोग स्टैंडअलोन या पॉलीकेटाइड सब्सट्रेट सब्सट्रेट विशिष्टता भविष्यवाणी सर्वर के साथ संयोजन में किया जा सकता है।
URL: http://www.nipgr.res.in/disc/linker.html


PLecDom:
डॉ. गीतांजलि यादव
PLecDom प्लांट लेक्टिन डोमेन की सब्सट्रेट विशिष्टता की पहचान, विश्लेषण और भविष्यवाणी के लिए एक कार्यक्रम है। इसमें लेक्टिन के लिए प्रोफ़ाइल हिडन मार्कोव मॉडल का संग्रह शामिल है और वर्तमान में पूर्ण हो चुके और चल रहे सभी प्लांट जीनोम प्रोजेक्ट से संबंधित भविष्यवाणियों को किसी भी संख्या में फास्टा अनुक्रम वाले उपयोगकर्ता विशिष्ट इनपुट के अलावा ब्राउज़ किया जा सकता है।
URL: PLecDom: http://www.nipgr.res.in/plecdom.html


आरमैनेजर:
डॉ. गीतांजलि यादव
यह कार्यक्रम अनिवार्य रूप से किसी संगठन के भीतर उपलब्ध संदर्भ लेखों का डेटाबेस है, सभी एक ही सर्वर में रखे गए हैं, जो डिस्क स्थान के बेहतर उपयोग को सक्षम बनाता है और प्रयोगशाला के भीतर उपयोगकर्ताओं को एक दूसरे के साथ साहित्य डेटा साझा करने और फ़ाइलों को एक निर्दिष्ट क्षेत्र में सुविधाजनक रूप से अपलोड और संग्रहीत करने की अनुमति देता है।
URL: http://www.nipgr.res.in/disc/rmanager.html


आवश्यक तेल डेटाबेस:
डॉ. गीतांजलि यादव
एस्सऑयलडीबी (एसेंशियल ऑयल डाटाबेस) पौधों के वाष्पशील उत्सर्जन के लिए लगातार अपडेट किया जाने वाला ज्ञान संसाधन है, जिसमें प्रकाशित रिपोर्टों से आवश्यक तेल संरचना डेटा के प्रयोगात्मक रिकॉर्ड शामिल हैं। एस्सऑयलडीबी में वैश्विक परिप्रेक्ष्य से वाष्पशील प्रोफ़ाइल पैटर्न की सराहना करने के लिए संग्रह और निष्कर्षण के समय संबंधित भू-आकृति विज्ञान कारकों पर जानकारी भी शामिल है। एस्सऑयलडीबी, टैक्सोनोमिक क्लेड्स, भौगोलिक स्थानों और कई अन्य जैविक और अजैविक प्रभावों में देशी, आक्रामक, सामान्य या तनावग्रस्त पौधों की वाष्पशील प्रोफाइल पर कई प्रश्नों के माध्यम से संदर्भ आधारित वैज्ञानिक अनुसंधान के लिए एक अवसर प्रदान करता है।
URL: http://nipgr.res.in/Essoildb/