प्रोटिओमिक्स


अवलोकन
प्रोटिओमिक्स विभिन्न जैविक प्रक्रियाओं में शामिल प्रोटीन का अध्ययन करने के लिए एक बहुत ही शक्तिशाली और आशाजनक दृष्टिकोण है। जीनोमिक अनुक्रम जानकारी की बढ़ती उपलब्धता के साथ-साथ नई विश्लेषणात्मक तकनीकें एक निश्चित स्थिति के तहत व्यक्त कोशिका या ऊतक में कई प्रोटीनों का समानांतर रूप से विश्लेषण करना संभव बनाती हैं। नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ प्लांट जीनोम रिसर्च में प्रोटिओमिक्स सुविधा प्रोटीन के गुणात्मक और मात्रात्मक लक्षण वर्णन के लिए प्रमुख तकनीक के रूप में मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग करती है। भारत सरकार के जैव प्रौद्योगिकी विभाग द्वारा वित्तपोषित यह सुविधा 2007 में प्रोटिओमिक्स अनुसंधान गतिविधियों को आरंभ करने, समन्वयित करने और सुविधा प्रदान करने के उद्देश्य से शुरू हुई थी। इस सुविधा के पास प्रोटिओमिक्स गतिविधियों के लिए कई उपकरण और अनुभव उपलब्ध हैं। सुविधा की सेवा आंतरिक और बाहरी उपयोगकर्ताओं के लिए उपलब्ध है।
गतिविधियाँ
इस सुविधा की गतिविधियाँ मुख्य रूप से प्रोटीन की पहचान और लक्षित पेप्टाइड्स की मात्रा निर्धारित करने पर केंद्रित हैं।
एसडीएस-पीएजी जेल बैंड के रूप में आपूर्ति किए गए प्रोटीन के नमूने और एमएस-संगत डाई या घोल में रंगे हुए, ट्रिप्टिक पाचन के अधीन होते हैं और मानक प्रोटोकॉल के अनुसार पेप्टाइड्स निकाले जाते हैं। पेप्टाइड्स का विश्लेषण इलेक्ट्रोस्प्रे आयनीकरण टाइम-ऑफ-फ़्लाइट मास स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा किया जाता है, जिसमें एक्सपर्ट नैनोएलसी 425 या साइक्स सीईएसआई 8000 प्लस सिस्टम के साथ ऑनलाइन युग्मित साइक्स ट्रिपलटीओएफ 6600 का उपयोग किया जाता है। एनालिस्ट सॉफ्टवेयर द्वारा उत्पन्न पीक सूची को MASCOT (http://www.matrixscience.com) सर्च इंजन या प्रोटीन पायलट सॉफ्टवेयर के विरुद्ध खोज कर पेप्टाइड्स की पहचान की जाती है। लक्षित पेप्टाइड्स का मात्रात्मक विश्लेषण Sciex QTRAP 6500+ का उपयोग करके Sciex Exion LC सिस्टम के साथ ऑनलाइन युग्मित करके किया जाता है।
उपकरण
 
एक्सियन LC-QTRAP 6500+   एक्सिजेंट एक्सपर्ट नैनोएलसी 425-ट्रिपलटीओएफ 6600

संपर्क:

वैज्ञानिक प्रभारी:

डॉ. मनोज माजी
डॉ. प्रभाकरन सुंदरराजन
डॉ. दिव्या मिश्रा

तकनीकी प्रभारी:

सुश्री उमामहेश्वरी राजमणि (एसटीओ)
श्री. नागा वर प्रसाद जी (एसटीओ)

ईमेल आईडी:

proteomics@nipgr.ac.in (बुकिंग और पूछताछ के लिए)
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