मेटाबोलोमिक्स सुविधा


मेटाबोलोमिक्स सुविधा, NIPGR

अवलोकन

मास स्पेक्ट्रोमेट्री एक शक्तिशाली विश्लेषणात्मक तकनीक है जिसका उपयोग अज्ञात यौगिकों की पहचान करने और ज्ञात मेटाबोलाइट्स की मात्रा निर्धारित करने के लिए किया जाता है।  भारत सरकार के जैव प्रौद्योगिकी विभाग (DBT) द्वारा वित्तपोषित राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (NIPGR) में मेटाबोलोमिक्स सुविधा दिसंबर 2019 में प्लांट मेटाबोलोमिक्स के लिए अत्याधुनिक विश्लेषणात्मक उपकरण मंच के रूप में काम करने के लिए शुरू हुई।  यह भारत में एक अनूठी सुविधा है जिसे प्लांट फाइटोहोर्मोन और कम प्रचुर मात्रा में मेटाबोलाइट्स की मात्रा निर्धारित करने और प्रोफाइलिंग के लिए डिज़ाइन किया गया है। हम विभिन्न जैविक अध्ययनों के लिए मेटाबोलाइट्स के विभिन्न वर्गों के मास स्पेक्ट्रोमेट्री-आधारित विश्लेषण और पूर्ण मात्रा निर्धारण के लिए सेवाएँ प्रदान करते हैं। यह सुविधा आंतरिक और बाहरी दोनों उपयोगकर्ताओं के लिए उपलब्ध है। प्लांट मेटाबोलाइट्स जिनका पता लगाया जा सकता है और जिन्हें सुविधा में मात्राबद्ध किया जा सकता है, उनमें शामिल हैं:

इंस्ट्रूमेंटेशन

मेटाबोलोमिक्स सुविधा में निम्नलिखित उपकरण उपलब्ध हैं:

  1. एलसी-एमएस/एमएस (ट्रिपल क्वाड्रुपोल)
  2. जीसी-एमएस/एमएस (ट्रिपल क्वाड्रुपोल)
  3. ICP-MS
  4. एचपीटीएलसी
  5. यू-एचपीएलसी
  6. माइक्रोवेव पाचन तंत्र
  7. जीनो ग्राइंडर
  8. घूमनेवाला वैक्यूम बाष्पीकरणकर्ता
  9. अल्ट्रा-टरैक्स डिजिटल होमोजेनाइज़र
  10. अल्ट्रा-सोनिकेटर
  11. फ़्रीज़र्स
  12. शेकर
  13. स्पीड वैक
  14. पंपों के साथ वैक्यूम मैनिफोल्ड
  15. परिशुद्धता संतुलन

प्लांट मेटाबोलाइट्स के अत्याधुनिक परिमाणीकरण के लिए मास स्पेक्ट्रोमेट्री

1)  गैस क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री - GC-MS/MS (TQ8050 NX)

गैस क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री (GC-MS) एक  विश्लेषणात्मक विधि है जोगैस क्रोमैटोग्राफी और मास स्पेक्ट्रोमेट्री, जो उच्च हस्तक्षेप मैट्रिक्स में अल्ट्रा-ट्रेस मात्राओं का अभूतपूर्व मात्रात्मक विश्लेषण करने में सक्षम है। थर्मल डिसोर्प्शन सिस्टम हमारे उपकरणों के साथ भी उपलब्ध है।

क्या मात्रा निर्धारित की जा सकती है:  अधिकांश प्राथमिक मेटाबोलाइट्स (जैसे शर्करा, शर्करा अल्कोहल, कार्बनिक अम्ल, कार्बनिक अम्ल एस्टर, अमीनो अम्ल), बेंजीनॉइड और टेरपेनॉइड वाष्पशील कार्बनिक यौगिक।  स्कैन मोड पर गैर-लक्षित मेटाबोलाइट प्रोफाइलिंग।

2) लिक्विड क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री- LC- MS/MS (QTRAP 6500+)

QTRAP-LC-MS/MS सिस्टम एक हाइब्रिड ट्रिपल क्वाड्रापोल रैखिक है आयन ट्रैप मास स्पेक्ट्रोमीटर। इसका उपयोग लक्षित मेटाबोलोमिक्स अनुप्रयोगों के लिए किया जाता है

क्या मात्रा निर्धारित की जा सकती है:  अमीनो एसिड, डिफेंस फाइटोहोर्मोन (जैसे जैस्मोनिक एसिड, एब्सिसिक एसिड और सैलिसिलिक एसिड), ग्रोथ फाइटोहोर्मोन (जैसे साइटोकाइनिन, ऑक्सिन), सेकेंडरी मेटाबोलाइट्स (जैसे फेनोलिक एसिड, एंथोसायनिन, फ्लेवोनोइड्स, संयुग्मित फेनोलिक यौगिक, एल्कलॉइड) को इस सुविधा में मापा जा सकता है।

3) हाई परफॉरमेंस थिन लेयर क्रोमैटोग्राफी (HPTLC-CAMAG)

HPTLC स्वचालित उपकरणों के साथ TLC का एक बेहतर रूप है और इसका उपयोग द्वितीयक मेटाबोलाइट्स की फिंगरप्रिंटिंग के लिए किया जाता है। अधिकांश पौधे से प्राप्त एंथोसायनिन और फ्लेवोनोइड्स को उच्च रिज़ॉल्यूशन में HPTLC के माध्यम से अलग किया जा सकता है।

4) इंडक्टिवली कपल्ड प्लाज़्मा मास स्पेक्ट्रोमेट्री - ICP-MS (एगिलेंट 7800)

इंडक्टिवली कपल्ड प्लाज़्मा मास स्पेक्ट्रोमेट्री (ICP-MS) एक प्रकार की मास स्पेक्ट्रोमेट्री है जिसका उपयोग तत्व विश्लेषण और नमूने में ट्रेस धातुओं और गैर-धातु आयनों का पता लगाने के लिए किया जाता है।

क्या मात्रा निर्धारित की जा सकती है:  धातु और गैर-धातु तत्व आयन, आयनोम प्रोफाइलिंग

संपर्क:

प्रभारी वैज्ञानिक:

ज्योतिलक्ष्मी वडस्सेरी (पीआई)
सेंथिल कुमार मुथप्पा (सह-पीआई)
आशुतोष पांडे (सह-पीआई)

बाहरी उपयोगकर्ताओं से अनुरोध है कि वे सुविधा से संपर्क करें - metabolome@nipgr.ac.in

नमूना तैयार करने के प्रोटोकॉल और प्रशिक्षण सुविधा द्वारा प्रदान किए जाएंगे

A) अनुभाग: लिंक

1) मूल्य सूची

  1. मूल्य सूची - GC-MS and LC-MS

  2. मूल्य सूची - ICP-MS and HPTLC

2) नमूना सबमिशन फ़ॉर्म- NIPGR आंतरिक उपयोगकर्ता

3) नमूना सबमिशन फ़ॉर्म - बाहरी उपयोगकर्ता

4) सुविधा पोस्टर

5) विधियाँ मानकीकृत

बी) अनुभाग: कर्मचारी

जगदीप सिंह (एसटीओ)

अचल प्रसाद (टीओ)

दिव्या गोयल (टीओ)

खुशबू शर्मा (एसपीए)