डॉ. शिव मीना
वैज्ञानिक, आरएनए बायोलॉजी लैब (102)पोस्टडॉक्टरल फेलो: उमेआ, प्लांट साइंस, सेंटर, उमेआ, स्वीडन
पीएचडी: लाइबनिज इंस्टीट्यूट ऑफ प्लांट बायोकेमिस्ट्री, हाले (साले), जर्मनी
टेलीफोन: फोन: 91-11-26741612/14/17 एक्सटेंशन। 104
डायरेक्ट: 91-1126735221
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शोध रुचियाँ
पौधों में व्यापक गैर-कोडिंग प्रतिलेखन का कार्यात्मक लक्षण वर्णन
पिछले दो दशकों में खोजों के सबसे महत्वपूर्ण सेटों में से एक जीनोम के 'डार्क मैटर' की रोशनी है। नवीन अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों के आगमन के परिणामस्वरूप यह दिखाया जा सकता है कि अधिकांश यूकेरियोटिक जीनोम व्यापक प्रतिलेखन से गुजरते हैं, जिसमें गैर-कोडिंग आरएनए के रूप में ट्रांसक्रिप्टोम का ~95% से अधिक हिस्सा शामिल होता है। ये नॉनकोडिंग आरएनए ट्रांसक्रिप्ट कई प्रकार के हो सकते हैं जैसे हाउसकीपिंग छोटे आरएनए, टी-आरएनए, आर-आरएनए, स्नोआरएनए, छोटे विनियामक आरएनए और लंबे नॉनकोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनएएस), अन्य। इस नॉनकोडिंग ट्रांसक्रिप्टोम का एक बड़ा हिस्सा एलएनसीआरएनएएस से बना है, गैर-प्रोटीन कोडिंग आरएनए अणु जो लंबाई में 200 न्यूक्लियोटाइड से अधिक लंबे होते हैं और प्रमोटर, इंट्रॉन, इंटरजेनिक डीएनए या एंटीसेंस डीएनए स्ट्रैंड के रूप में वर्गीकृत जीनोमिक क्षेत्रों से आरएनए पोल II द्वारा ट्रांसक्रिप्ट किए जा सकते हैं। एलएनसीआरएनएएस विभिन्न मौलिक जैविक प्रक्रियाओं में प्रमुख नियामकों के रूप में उभरे हैं, जिसमें जानवरों और पौधों दोनों में वृद्धि, विकास, बीमारी और तनाव प्रतिक्रियाएं शामिल हैं। lncRNAs विभिन्न तंत्रों के माध्यम से प्रत्यक्ष या अप्रत्यक्ष रूप से लक्ष्य जीन की अभिव्यक्ति को विनियमित कर सकते हैं, जैसे miRNAs की लक्ष्य नकल, R-लूप गठन, ट्रांसक्रिप्शनल टकराव, RNA साइलेंसिंग, आदि। साक्ष्यों की बढ़ती संख्या यह संकेत देती है कि lncRNAs की कार्यात्मक और यांत्रिक खोज न केवल जीनोम के 'डार्क मैटर' के रहस्यों को उजागर करेगी, बल्कि कृषि और जैव प्रौद्योगिकी में नए निष्कर्षों और गैर-कोडिंग RNA-आधारित अनुप्रयोगों का मार्ग भी प्रशस्त करेगी।
यद्यपि उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण अध्ययनों ने हजारों lncRNAs की पहचान करने में सक्षम बनाया है, लेकिन पौधों में lncRNAs के केवल एक छोटे से अंश को प्रयोगात्मक रूप से चिह्नित किया गया है। उल्लेखनीय रूप से, पशु प्रणालियों में की गई सापेक्ष प्रगति की तुलना में, पौधों में lncRNAs की भूमिका या सामान्य रूप से गैर-कोडिंग प्रतिलेखन, उनकी आणविक क्रियाविधि और lncRNAs (यदि कोई हो) से जुड़े सामान्य RNA मध्यस्थ विनियामक तंत्रों के बारे में हमारी समझ अभी शुरू ही हुई है।
एनआईपीजीआर, नई दिल्ली में हमारे आरएनए जीवविज्ञान समूह में कुछ प्राथमिक शोध दिशाओं में i) नवीन विनियामक lncRNAs की पहचान और कार्यात्मक लक्षण वर्णन, ii) जैविक रूप से महत्वपूर्ण गैर-कोडिंग आरएनए मध्यस्थता वाले जीनोम-व्यापी ट्रांसक्रिप्शनल व्यवहारों का अध्ययन, और iii) इस बात की जांच शामिल है कि क्या lncRNAs सामान्य विनियामक तंत्रों को अनुकूलित करते हैं, उदाहरण के लिए, एक वर्ग के रूप में एंटीसेंस lncRNAs iv) पौधों में नवीन जीनोमिक्स उपकरणों का अनुप्रयोग, अनुकूलन और उन्नति।
हम अपने प्रयोगों में विविध आणविक आनुवंशिक, आरएनए जीवविज्ञान, जैव रासायनिक, जैवभौतिक और उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण दृष्टिकोणों को नियोजित करते हैं। हमारे अध्ययन विकास, अजैविक और जैविक तनाव स्थितियों पर जोर देते हैं। हम विशेष रूप से अरेबिडोप्सिस थालियाना, चना और टमाटर में मॉडल तनाव के रूप में क्षणिक ठंड (ठंढ), गर्मी और सूखे का उपयोग करने पर ध्यान केंद्रित करते हैं। लंबे समय में,हमारा लक्ष्य अंततः पौधों में गैर-कोडिंग प्रतिलेखन और lncRNA भूमिकाओं की आणविक समझ उत्पन्न करना है जिसका उपयोग अनुप्रयुक्त कृषि और जलवायु-लचीली फसलों के विकास में किया जा सकता है।
सेंस-एंटीसेंस प्रतिलेखन, एंटीसेंस lncRNAs और ओवरलैपिंग प्रोटीन-कोडिंग कारकों का अध्ययन
पौधों में कुल एनोटेट जीनों में से 40-70% तक एंटीसेंस lncRNAs का उत्पादन करने का अनुमान है। पौधों में कार्यात्मक रूप से विशेषता वाले एंटीसेंस lncRNAs के कुछ उपलब्ध उदाहरणों में COOLAIR, asDOG1, asHSFB2A, SVALKA, NATsUGT73C6 शामिल हैं। 'सेंस-एंटीसेंस' परिघटना को समझने में योगदान देने के लिए, हम समूह में निम्नलिखित विषयों पर ध्यान केंद्रित करते हैं-
- एंटीसेंस lncRNAs की भूमिकाओं का लक्षण वर्णन जो प्रोटीन-कोडिंग जीन के साथ ओवरलैप करते हैं, और क्रिया के संबंधित आणविक तंत्र।
- व्यापक सेंस-एंटीसेंस ट्रांसक्रिप्शन की स्थानीय और वैश्विक ट्रांसक्रिप्शनल गतिशीलता की जांच, और नियामक प्रक्रियाएं जो पौधों में विकासात्मक और तनाव प्रतिक्रियाओं के दौरान इष्टतम गैर-कोडिंग और कोडिंग ट्रांसक्रिप्शनल आउटपुट को नियंत्रित करती हैं।
पौधों में नवीन जीनोमिक्स उपकरणों का अनुकूलन और उन्नति (जैसे, plaNET-Seq, Ribo-Seq)
जलवायु परिवर्तन की चुनौतियाँ: lncRNAs को अनलॉक करना और टिकाऊ कृषि के लिए गैर-कोडिंग प्रतिलेखन केंद्रित समाधान
जलवायु परिवर्तन के कारण, भविष्य के मौसमों के चरम और अप्रत्याशित होने का संदेह है, जिसमें उच्च आवृत्ति वाले गंभीर वसंत और सर्दियों के ठंढ, अप्रत्याशित सूखा और अन्य अजैविक तनाव शामिल हैं और इस प्रकार फसलों और टिकाऊ कृषि के लिए एक बड़ी चुनौती पेश करते हैं। lncRNAs को विकास और तनाव प्रतिक्रियाओं दोनों के लिए महत्वपूर्ण माना जाता है और संभावित रूप से पौधों की कठोर मौसम स्थितियों का सामना करने की क्षमता की कुंजी है। lncRNAs की नियामक भूमिकाओं को समझकर और उनका उपयोग करके, हमारा लक्ष्य अजैविक तनाव स्थितियों जैसे ठंढ और सूखे के लिए बेहतर सहनशीलता वाली फसल किस्मों को विकसित करना है।
समूह सदस्य
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टोटा मोंडल पीएचडी छात्र तोता बांकुरा, पश्चिम बंगाल, भारत में पले-बढ़े। उन्होंने बर्दवान विश्वविद्यालय से वनस्पति विज्ञान में स्नातक की डिग्री प्राप्त की और विश्वभारती विश्वविद्यालय से वनस्पति विज्ञान में स्नातकोत्तर की डिग्री पूरी की, जिसे SVMCM फेलोशिप द्वारा समर्थित किया गया। एम.एस.सी. करने के बाद, वह एनआईपीजीआर (नई दिल्ली) में एक प्रोजेक्ट एसोसिएट के रूप में हमारे आरएनए बायोलॉजी ग्रुप में शामिल हुईं, जहाँ उन्हें एंटीसेंस लॉन्ग नॉन-कोडिंग आरएनए और पौधों में उनकी भूमिका से परिचित कराया गया। lncRNAs से प्रभावित होकर, उन्होंने अगस्त 2024 में NIPGR की उसी प्रयोगशाला में अपनी पीएचडी यात्रा शुरू की। उनका पीएचडी कार्य आणविक तंत्र (तंत्रों) की खोज पर केंद्रित है जिसके द्वारा lncRNAs क्षणिक अजैविक तनावों के तहत जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करते हैं। उनका उद्देश्य उच्च-स्तरीय ट्रांसक्रिप्टोमिक्स उपकरणों जैसे कि क्रॉपनेट-सीक को आगे बढ़ाकर तनाव-प्रतिरोधी चने की किस्मों के विकास में योगदान देना है। |
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गौरव महरिया
पीएचडी छात्र गौरव का जन्म और पालन-पोषण हनुमानगढ़, राजस्थान में हुआ। उन्होंने अपनी कृषि में बनारस हिंदू विश्वविद्यालय, वाराणसी से स्नातक की डिग्री प्राप्त की। इसके बाद उन्होंने जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय, नई दिल्ली से जैव प्रौद्योगिकी में मास्टर डिग्री पूरी की, जिसमें डॉ. मनोज कुमार शर्मा के समूह में मास्टर थीसिस का काम किया। अगस्त 2024 में, वे नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ प्लांट जीनोम रिसर्च (NIPGR) में पीएचडी स्कॉलर के रूप में हमारे समूह में शामिल हुए। उनका काम चने में अजैविक तनाव के दौरान गैर-कोडिंग आरएनए-एनकोडेड छोटे पेप्टाइड्स पर केंद्रित है। गौरव छोटे पेप्टाइड्स की इन-प्लांटा भूमिकाओं को उजागर करने के लिए रिबो-सीक, मास स्पेक्ट्रोमेट्री और इन-सिलिको दृष्टिकोण जैसी अत्याधुनिक तकनीकों का उपयोग करेंगे। |
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सान्या बजाज प्रोजेक्ट एसोसिएट-1 सान्या भिवानी, हरियाणा, भारत से हैं। उन्होंने भिवानी में चौधरी बंसीलाल विश्वविद्यालय से अपनी स्नातक की डिग्री पूरी की और हिसार में गुरु जम्भेश्वर विज्ञान एवं प्रौद्योगिकी विश्वविद्यालय से अपनी मास्टर डिग्री हासिल की। नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ प्लांट जीनोम रिसर्च (NIPGR) में हमारे समूह में उनकी मास्टर थीसिस पौधों के विकास में क्रोमेटिन रीमॉडेलर की भूमिका के विश्लेषण पर केंद्रित थी। उसने हमारी प्रयोगशाला में प्रोजेक्ट एसोसिएट के रूप में काम जारी रखने का फैसला किया। सान्या को आणविक तंत्रों का और पता लगाने के लिए प्रेरित किया जाता है जिसके द्वारा तेजी से क्रोमेटिन रीमॉडलिंग पौधों में क्षणिक गैर-कोडिंग प्रतिलेखन तरंगों में योगदान दे सकता है, जैसे कि अरेबिडोप्सिस और चना। |
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मनोबिका दास आगंतुक छात्र मनोबिका का पालन-पोषण बांकुरा, भारत में हुआ। उन्होंने अपनी बी.एससी. बांकुरा क्रिश्चियन कॉलेज से वनस्पति विज्ञान में डिग्री। उसने फिर विश्वभारती विश्वविद्यालय में दाखिला लिया, ताकि वनस्पति विज्ञान में एम.एससी. की पढ़ाई कर सके, जिसमें प्लांट फिजियोलॉजी और बायोकेमिस्ट्री पर ध्यान केंद्रित किया गया। उसे पौधों के विकास में miRNA-मध्यस्थता विनियमन की भूमिका को समझने में विशेष रुचि है। अप्रैल 2023 में, मनोबिका ने प्रो. आनंद सरकार की लैब में पीएचडी छात्र के रूप में जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय जॉइन किया। वह वनस्पति चरण परिवर्तन में चयनित miRNA की भूमिका का अध्ययन करने के लिए एक सहयोगी छात्र के रूप में हमारे समूह में शामिल हुई। |
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नित्या तिवारी
मास्टर छात्रा नित्या उत्तर प्रदेश, भारतकी मूल निवासी हैं। उन्होंने एक मजबूत व्यक्तित्व विकसित किया है। स्कूली शिक्षा के दौरान विज्ञान में उनकी रुचि थी। उन्होंने बनस्थली विद्यापीठ, राजस्थान से बायोटेक्नोलॉजी में अपनी उच्च शिक्षा (बीएससी और एमएससी) हासिल की। वह एक प्रेरित मास्टर की छात्रा हैं और पौधों में सेंस-एंटीसेंस पहेली का पता लगाने के लिए आणविक आनुवंशिकी और आरएनए जीवविज्ञान दृष्टिकोण का उपयोग करना चाहती हैं। एनआईपीजीआर में हमारे समूह में नित्या की मास्टर थीसिस का काम अरेबिडोप्सिस में चुनिंदा सेंस-एंटीसेंस ट्रांसक्रिप्शनल इकाइयों के सीआईएस और ट्रांस विनियामक पहलुओं की खोज करता है। |
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अक्षिता नायक
मास्टर छात्र अक्षिता मध्य प्रदेश, भारत से आती हैं। उन्होंने डॉ. हरि सिंह गौर, केंद्रीय विश्वविद्यालय से जीव विज्ञान में बी.एस.सी. और जैव प्रौद्योगिकी में एम.एस.सी. की पढ़ाई की।उन्हें जटिल अमूर्त पहेलियाँ सुलझाना पसंद है और पौधों में lncRNAs का अध्ययन करने में उनकी बहुत रुचि है। वह यह जानने के लिए उत्साहित हैं कि लंबे समय तक तनाव की स्थिति में आणविक स्तर पर एंटीसेंस lncRNA कैसे काम करता है। अक्षिता ने जनवरी 2025 में आरएनए बायोलॉजी लैब में अपने मास्टर थीसिस के लिए शामिल हुईं, जिसका उद्देश्य अरेबिडोप्सिस में सूखे के तनाव के दौरान lncRNA की भूमिका को दर्शाना था। |