डॉ. सुदीप चट्टोपाध्याय
FNA, FASc., FNASc., रमन्ना फेलोस्टाफ साइंटिस्ट VI (प्रोफेसर)
टेलीफोन: 91-11-26741612,14,17 एक्सटेंशन - 175
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ईमेल: sudip.chattopadhyay@nipgr.res.in, sudipchatto@yahoo.com
समूह सदस्य
| डॉ. सुदीप चट्टोपाध्याय लैब | |
| श्री वी. बाबू राजेंद्र प्रसाद | पीएचडी छात्र |
| सुश्री अपर्णा सिंह | पीएचडी। छात्र |
| सुश्री नाजिया अब्बास | पीएचडी छात्र |
| श्री हाथी राम | पीएचडी छात्र |
| सुश्री विश्मिता सेठी | पीएचडी छात्र |
| चट्टोपाध्याय लैब-पूर्व छात्र | |
| हेत्तियाराच्ची, जीएम | पूर्व पीएचडी। छात्र (मार्च, 2000 - अक्टूबर 2003) |
| वी. सेल्वाकुमार | पूर्व पोस्टडॉक (सितंबर, 2002 - मार्च 2005) |
| वंदना यादव | पूर्व पीएचडी छात्र (जनवरी, 2001 - नवंबर 2004) |
| शिखा भाटिया | पूर्व पोस्टडॉक (अप्रैल, 2004 - अगस्त 2006) |
| स्नेहंगशु कुंडू | पूर्व पीएचडी छात्र |
| श्रीरामैया एनजी | पूर्व पीएचडी छात्र |
| रितु कुशवाह | पूर्व पीएचडी छात्र |
| चंद्रशेखर एम | पूर्व पीएचडी छात्र |
प्रोफ़ाइल
शोध क्षेत्र
पौधे की वृद्धि और विकास के लिए प्रकाश सबसे महत्वपूर्ण कारकों में से एक है, और प्रकाश संकेतन मार्गों के साथ अन्य संकेतन कैस्केड की क्रॉस टॉक को सुलझाया जाना शुरू हो गया है। प्रकाश की उपस्थिति या अनुपस्थिति के आधार पर, अरेबिडोप्सिस के पौधे दो अलग-अलग विकासात्मक मार्गों के साथ बढ़ते हैं: अंधेरे में स्कोटोमोर्फोजेनेसिस या एटिओलेशन और प्रकाश में फोटोमोर्फोजेनेसिस या डीटिओलेशन। प्रकाश को कई फोटोरिसेप्टर द्वारा माना जाता है: फाइटोक्रोम (phyA से phyE) द्वारा दूर लाल और लाल प्रकाश और क्रिप्टोक्रोम (cry1, cry2 और cry3) द्वारा नीला और UV-A प्रकाश। फोटोरिसेप्टर की कार्यात्मक भूमिका निर्धारित करने और प्रारंभिक सिग्नलिंग घटकों की पहचान करने में एक महत्वपूर्ण प्रगति हासिल की गई है। हालांकि, फोटोरिसेप्टर से डाउनस्ट्रीम ट्रांसक्रिप्शन कारकों तक सिग्नल ट्रांसडक्शन अस्पष्ट बना हुआ है।
हम प्रकाश सिग्नलिंग मार्गों में Z-बॉक्स विशिष्ट ट्रांसक्रिप्शन कारकों की जांच कर रहे हैं। जब हमारी प्रयोगशाला ने Z-बॉक्स और इसके संबंधित ट्रांसक्रिप्शन कारकों के कार्य की जांच शुरू की, तब पौधों में Z-बॉक्स और इसके विनियमन के बारे में व्यावहारिक रूप से कुछ भी ज्ञात नहीं था। हम यह प्रदर्शित करने में सफल रहे हैं कि Z-बॉक्स बाइंडिंग कारक (ZBF) पौधे में मौजूद हैं और पौधे की वृद्धि और विकास में अंतरंग रूप से शामिल हैं। हमने Z-बॉक्स को जांच के रूप में उपयोग करके लिगैंड-बाइंडिंग स्क्रीन द्वारा कई ट्रांसक्रिप्शन कारकों को क्लोन किया है। कई ऐसे Z-बॉक्स बाइंडिंग कारकों को कार्यात्मक रूप से विशेषता दी गई है। उदाहरण के लिए, ZBF1/MYC2 (एक bHLH ट्रांसक्रिप्शन कारक) के कार्यात्मक लक्षण वर्णन से पता चलता है कि ZBF1 फोटोमॉर्फोजेनिक विकास के नकारात्मक नियामक के रूप में कार्य करता है, हालांकि यह फूल आने के समय और पार्श्व जड़ गठन के सकारात्मक नियामक के रूप में कार्य करता है। इसके अलावा, ZBF1 पौधों में पहला प्रतिलेखन कारक है जिसे प्रकाश, ABA (एब्सिसिक एसिड) और JA (जैस्मोनिक एसिड) सिग्नलिंग मार्गों के बीच क्रॉस टॉक के बिंदु के रूप में कार्य करने के लिए दिखाया गया है। हमने अन्य प्रकाश सिग्नलिंग घटकों के साथ ZBF1 के आनुवंशिक और आणविक अंतर्संबंधों की जांच की है। zbf1 cop1 डबल म्यूटेंट के जीनोम-वाइड ट्रांसक्रिप्शनल प्रोफाइलिंग (माइक्रोएरे) आगे प्रदर्शित करता है कि COP1 और ZBF1/MYC2 प्रकाश, कई तनावों और विभिन्न चयापचय मार्गों में शामिल नियामक जीनों की एक विस्तृत श्रृंखला की अभिव्यक्ति को समन्वित रूप से नियंत्रित करते हैं। आणविक स्तर पर ZBF2/GBF1 (एक bZIP प्रतिलेखन कारक) के लक्षण वर्णन से पता चलता है कि ZBF2 पौधों की वृद्धि और विकास को अलग-अलग तरीके से नियंत्रित करता है और जड़ की वृद्धि, फूल आने के समय और ABA के प्रति प्रतिक्रियाशीलता को बढ़ावा देता है। आगे की जांच से पता चला है कि ZBF2/GBF1 प्रोटीन अंधेरे में कम प्रचुर मात्रा में होता है, और COP1 और SPA1, फोटोमोर्फोजेनेसिस के नकारात्मक नियामकों से स्वतंत्र प्रोटीसोम-मध्यस्थ मार्ग द्वारा अपघटित होता है। COP1 ZBF2 के साथ शारीरिक रूप से अंतःक्रिया करता है और प्रकाश में उगाए गए पौधों में ZBF2 प्रोटीन के इष्टतम संचय के लिए आवश्यक है।
चयनित प्रकाशन
| मल्लप्पा सी, सिंह ए, राम एच और चट्टोपाध्याय एस (2008) जीबीएफ1, अरबीडोप्सिस में नीली रोशनी संकेतन का एक प्रतिलेखन कारक, अंधेरे में एक प्रोटीसोम-मध्यस्थ मार्ग द्वारा अपघटित होता है जो कॉप1 और एसपीए 1 से स्वतंत्र होता है। जर्नल ऑफ बायोलॉजिकल केमिस्ट्री 283: 35772-35782। |
| कुशवाहा आर, सिंह ए और चट्टोपाध्याय एस (2008) कैल्मोडुलिन 7 अरबीडोप्सिस अंकुर विकास में प्रतिलेखन विनियामक के रूप में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। प्लांट सेल 20: 1747-1759. |
| भाटिया एस, गंगप्पा एसएन, कुसवाहा आर, कुंडू एस और चट्टोपाध्याय एस (2008) शॉर्ट हाइपोकोटाइल इन व्हाइट लाइट1, अरबीडोप्सिस में एक सेरीन-आर्जिनिन-एस्पार्टेट-रिच प्रोटीन, फोटोमॉर्फोजेनिक वृद्धि के नकारात्मक नियामक के रूप में कार्य करता है। प्लांट फिजियोलॉजी 147: 169-178. |
| भाटिया एस, गंगप्पा एसएन और चट्टोपाध्याय एस (2008) SHW1, एब्सिसिक एसिड (एबीए) और प्रकाश सिग्नलिंग मार्गों का एक सामान्य विनियामक। प्लांट सिग्नलिंग और व्यवहार 3: 1-3. |
| मल्लप्पा सी, यादव वी, नेगी पी और चट्टोपाध्याय एस (2006) एक बुनियादी ल्यूसीन जिपर प्रतिलेखन कारक, जी-बॉक्स-बाइंडिंग फैक्टर 1, अरबीडोप्सिस में नीली रोशनी-मध्यस्थ फोटोमोर्फोजेनिक वृद्धि को नियंत्रित करता है। जर्नल ऑफ बायोलॉजिकल केमिस्ट्री 281: 22190-22199. |
| यादव वी, चंद्रशेखर एम, श्रीरामैया एनजी, भाटिया एस और चट्टोपाध्याय एस (2005) अरबीडोप्सिस में एक बुनियादी हेलिक्स-लूप-हेलिक्स ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर, MYC2, नीली रोशनी-मध्यस्थ फोटोमॉर्फोजेनिक वृद्धि के दमनकर्ता के रूप में कार्य करता है। प्लांट सेल 17: 1953-1966. |
| हेत्तियाराच्ची जीएचसीएम, यादव वी, रेड्डी एमके और चट्टोपाध्याय एस (2005) मटर और ट्रांसजेनिक तम्बाकू पौधों में ठंड और लवणता सहित विभिन्न अजैविक तनावों द्वारा TOP2 का विनियमन। प्लांट सेल फिजियोलॉजी। 46: 1154-1160. |
| हेत्तियाराच्ची जीएचसीएम, यादव वी, रेड्डी एमके, चट्टोपाध्याय एस और सोपोरी एसके (2003) प्रकाश मध्यस्थता विनियमन TOP2 के न्यूनतम प्रमोटर क्षेत्र को परिभाषित करता है। न्यूक्लिक एसिड रिसर्च 31: 5256-5265. |
| यादव वी, कुंडू एस, चट्टोपाध्याय डी, नेगी पी, वेई एन, डेंग एक्सडब्ल्यू और चट्टोपाध्याय एस (2002)। अरबीडोप्सिस थालियाना में फोटोरिसेप्टर और डाउनस्ट्रीम विनियामक घटकों, COP1 और HY5 द्वारा Z-बॉक्स युक्त प्रमोटरों का प्रकाश विनियमित मॉड्यूलेशन। प्लांट जर्नल 31: 741-753। |