विशिष्ट अनुसंधान के क्षेत्र
केंद्र में पादप अनुसंधान के अग्रणी क्षेत्रों जैसे जीनोम खनन, आणविक मानचित्रण, तनाव जीव विज्ञान और फसल सुधार के लिए पोषण जीनोमिक्स में मजबूत चल रहे कार्यक्रम हैं, जो उच्च पैदावार के लिए उन्नत किस्मों के विकास में योगदान देते हैं। नेक्स्ट जनरेशन सीक्वेंसिंग (NGS) और हाई थ्रूपुट (HTP) प्रोटिओमिक प्रयोगों से बायोमॉलिक्यूलर डेटा (जीनोम, ट्रांसक्रिप्टोम, एपिजीनोम, प्रोटिओम और अन्य - विविध कोशिकाओं, ऊतकों और जीवों से ओमिक्स डेटा) के हालिया विस्फोट के साथ, बड़े डेटासेट का निर्माण और विश्लेषण अब NIPGR में अनुसंधान का एक नियमित और महत्वपूर्ण हिस्सा बन गया है।
BTISNET समन्वयक समूह जीन अभिव्यक्ति के ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन के क्षेत्र में काम करता है, जिसका मुख्य ध्यान मध्यस्थ परिसर पर है। समूह ने परिसर में सबयूनिट्स के संगठन और परिसर की लचीलेपन को समझने में पर्याप्त प्रगति की है। समन्वयक समूह की चावल और अरेबिडोप्सिस के जीनोमिक्स में भी रुचि है। समन्वयक समूह उच्च थ्रूपुट अनुक्रमण डेटासेट का विश्लेषण करके नए अणुओं की पहचान, लक्षण वर्णन और सत्यापन सहित पादप जीनोम अनुसंधान में कई नए क्षेत्रों की खोज कर रहा है। अणुओं की उनकी पसंद में स्थानांतरण आरएनए-व्युत्पन्न टुकड़े (जैसे टीआरएफ), संलयन प्रतिलेख, परिपत्र आरएनए और राइबोसोमल आरएनए-व्युत्पन्न टुकड़े (जैसे आरआरएफ) शामिल हैं। इसके अलावा, वे जैविक अनुसंधान समुदाय के लिए सिलिको उपकरण, पाइपलाइन, वेब-सर्वर और डेटाबेस भी विकसित कर रहे हैं।
वर्तमान शोध की मुख्य बातें
- हमने मध्यस्थ परिसर के विकार का विश्लेषण किया और परिसर की समग्र संरचना की लचीलापन की व्याख्या की। यह मध्यस्थ के क्षेत्र में एक महत्वपूर्ण योगदान है।
- हमने अरेबिडोप्सिस के मध्यस्थ परिसर में उप-इकाइयों की व्यवस्था का पता लगाया। चूंकि पौधे की संरचना मध्यस्थ परिसर अभी तक हल नहीं हुआ है, इसलिए यह शोधपत्र पौधे के मध्यस्थ की संरचना कार्य को समझने में एक महत्वपूर्ण योगदान है।
- चार चावल परिग्रहण के पूरे जीनोम अनुक्रमों का विश्लेषण किया गया। इससे तीन नए अनाज आकार/भार क्यूटीएल की पहचान करने में मदद मिली।
- हमने चावल के गुणसूत्र 5 के सेंट्रोमेरिक क्षेत्र के आसपास एक कम विविधता वाले क्षेत्र की विशेषता बताई है। यह चावल के पालतूकरण को समझने में महत्वपूर्ण अध्ययन है।
- हम पौधे में दो नए अणुओं का अध्ययन कर रहे हैं जैसे। RNA-व्युत्पन्न अंशों (tRFs) और संलयन प्रतिलेखों को स्थानांतरित करें।
- हमने व्यापक डेटा संग्रह किया और 10 विभिन्न पौधों की प्रजातियों (अध्ययन प्रकाशित) के लिए सभी तीन प्रकार के tRFs (जैसे tRF-5, tRF-3 और tRF-1) की पहचान की। हमने tRFs की पहचान के लिए एक सॉफ्टवेयर पैकेज भी विकसित किया है। हमने चावल, टमाटर और चने में विभिन्न तनाव स्थितियों में tRFs की पहचान और विश्लेषण भी किया है।
- फ्यूजन प्रतिलेख डीएनए या आरएनए स्तर पर संलयन के कारण उत्पन्न होने वाले काइमेरिक आरएनए हैं। वे प्रतिलेख या तो लंबे गैर-कोडिंग आरएनए के रूप में कार्य कर सकते हैं या उपन्यास काइमेरिक प्रोटीन को एनकोड कर सकते हैं। हमने अरेबिडोप्सिस थालियाना के युग्मित-अंत RNA-Seq डेटासेट में संलयन प्रतिलेखों की पहचान करके काम शुरू किया।
- हमारे समूह द्वारा विकसित प्लांट tRFs, tRNAs और संलयन प्रतिलेखों का पहला डेटाबेस।
- छोटे RNA अनुक्रमण डेटासेट में tRFs की पहचान के लिए कार्यप्रणाली विकसित की, जैसे tRF-PRED: tRFs की भविष्यवाणी के लिए सॉफ़्टवेयर पैकेज।
